食品厂净化工程大致可以分为三个区域：普通作业区、清洁区、清洁作业区。

一般作业区域(非清洁区域):一般原材料、成品、工具存放区域，包装成品转运区域等原材料.成品裸露风险低的区域，如外包装室、原辅仓、包装材料库、外包装车间、成品库房等。

准清洁区域：其次是要求，如原材料处理、包装材料处理、包装、缓冲室（拆卸室）、一般生产加工室、非即食食品内包装室等成品处理区域，但不直接暴露。

清洁工作区域：是指对卫生环境和人员有较高要求的环境。环境要求很高，只有经过消毒和更衣后才能进入，如原：原材料。成品的裸露处理区域，食品的冷加工室。即食品的冷却室。即食品的储藏室。即食品的内包装室等。

在选址、设计、布局、施工和改造过程中，食品厂净化工程应避免污染源、交叉污染、混料和误差的发生。

(1)环境整洁，人流合理，物流合理。

(2)为防止未经批准的人员进入，应采取适当的门禁措施。

(3)建筑和施工的竣工资料保存。

(4)厂区常年多风向的下风侧应建造生产过程中空气污染较严重的建筑物。

(5)当相互影响的生产过程不适合在同一建筑中时，应在各自的生产区域之间采取有效的隔断措施。发酵车间应用于生产发酵产品。

食品厂净化工程要求：

清洁生产区内应进行有无菌要求但不能实施终灭菌的工艺和虽能实现终灭菌，但灭菌后无菌操作的工艺。

具有良好卫生生产环境要求的清洁生产区域，应包括易腐食品。即冷却或包装前食用半成品或成品。加工场所，不能终灭菌的原料预加工。产品密封罐。成型场所，产品终灭菌后的暴露环境，包装材料准备区和内包装室，以及加工处理场所和检验室，以改善食品特性或保存性。

清洁生产区域应合理布局生产工艺及相应的清洁用房等级。生产线的布置不应造成往返交叉和不连续性。

缓冲室面积不应小于3平方米，生产区域内相互联系的不同车间应符合品种和工艺的需要，必要时应采取缓冲室等措施，防止交叉污染。

不得使用与成品生产相同的洁净区域进行原料前处理。

检查室应独立设置，并应采取适当措施对其排气和排水进行处理。如果对产品的检验过程有空气清洁要求，则应设置清洁工作台。